Lúc bắt đầu Chiến tranh thế giới thứ hai, Drahonowska-Małkowska đang điều hành một trường học sử dụng các nguyên lý Hướng đạo. Khi chiến tranh bùng nổ, bà đưa các học sinh bằng xe lửa đến một quốc gia trung lập. Chuyến xe lửa thường xuyên bị súng máy trên các máy bay bắn vào. Drahonowska-Małkowska cho rằng các trẻ em nhờ đã được huấn luyện Hướng đạo nên đã tự cứu mình. Khi xe lửa bị tấn công, các trẻ em được huấn luyện kỷ luật đầy đủ đã tuân lệnh bà tản ra khiến các xạ thủ bắn tỉa trên máy bay khó nhắm vào họ hơn là những hành khách khác tạo thành những nhóm hỗn độn.

Khi Olga Drahonowska-Małkowska tới được Vương quốc Anh, Hội Nữ Hướng đạo Vương quốc Anh trao tặng bà huân chương Thánh giá Đồng vì hành động dũng cảm.

Bà mất lúc 91 tuổi tại Zakopane.